Equipe Traitement de l'information en Biologie Santé

Responsable : Thierry Lecroq

Objectifs

Rechercher, indexer et extraire des informations pertinentes dans : des données biologiques (génomes et expression des génomes) ; des systèmes d’information en santé (CISMeF, serveur multiterminologies de santé, dossier électronique du patient).

Approches

  • structures d’indexation
  • indexation automatique
  • algorithmes de recherche de motifs et de recherche d'information

Equipe TIBS

Liens

Personnel

  • 20permanents
  • 2,5doctorants

Applications

  • biologie (séquences génomiques)
  • santé (données textuelles non structurées)

Mots clés

  • Algorithmique du texte
  • Bioinformatique
  • Génomique
  • Statistiques
  • Recherche d'informations multiterminologiques
  • Interopérabilité sémantique inter et intra terminologies

Projets en cours

  • Projet C3G (Correction de données de 3ème génération) du défi Mastodons du CNRS

Partenaires

Collaborations Internationales

  • NLM (USA)
  • NIPH (Japon)
  • King's College London (UK)
  • Université de Catane (Italie)
  • Université de Palerme (Italie)
  • Université Nationale de Seoul (Corée du Sud)

Partenaires industriels

  • OmicX
  • Vidal
  • Mémodata
  • Mondéca
  • BioMérieux

Réseaux de recherche

Réseaux d’Intérêts Normands (RIN)

  • Normandie Digitale
  • Normandie Biomédicale et Chimie

Autres réseaux

  • GDR IM - groupe de travail COMATEGE
  • GDR BIM - axe scientifique analyse des séquences
  • Commission Scientifique Spécialisée CSS6 : ≪ e-santé, Techno santé, santé pub. ≫
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